Este tipo de gastrenterite é provocado pela ingestão de alimentos contaminados por uma toxina produzida pela bactéria Clostridium perfringens. Algumas variedades provocam uma doença, entre ligeira e moderada, que melhora sem tratamento. Outras, no entanto, provocam um tipo de gastrenterite grave e muitas vezes mortal. Algumas toxinas não são destruídas pela cocção, enquanto outras o são. Geralmente, a carne contaminada é a responsável pelos surtos de contaminação alimentar por Clostridium perfringens.

Normalmente, a gastroenterite é leve, embora possa ocorrer um quadro grave com:

- Dor abdominal

- Distensão abdominal devida ao acúmulo de gás

- Diarréia intensa

- Desidratação e choque.

É realizada a administração de líquidos ao indivíduo e o repouso é aconselhado. Nos casos mais graves, a penicilina pode ser útil. Quando a doença destrói uma parte do intestino delgado, esta será removida cirurgicamente.